Biopython 简明教程

本节说明如何在机器上安装 Biopython。安装它非常容易，不超过五分钟。

Step 1 − 验证 Python 安装

Biopython 被设计为与 Python 2.5 或更高版本一起使用。因此，必须先安装 python。在命令提示符中运行以下命令 −

它在下面定义 −

如果安装正确，它将显示 python 的版本。否则，下载最新版本的 python，将其安装，然后重新运行该命令。

Step 2 − 使用 pip 安装 Biopython

在所有平台上，使用 pip 从命令行安装 Biopython 非常简单。键入以下命令 −

将在屏幕上看到以下响应 −

要更新较早版本的 Biopython −

将在屏幕上看到以下响应 −

执行此命令后，在安装最新版本的 Biopython 和 NumPy（Biopython 依赖于它）之前，将删除旧版本的 Biopython 和 NumPy。

Step 3 − 验证 Biopython 安装

现在, 你已经成功地在你的机器上安装了 Biopython。为了验证 Biopython 是否正确地安装, 在你的 python 控制台上输入一下命令 −

它显示 Biopython 的版本。

Alternate Way − Installing Biopython using Source

要使用源代码安装 Biopython, 请遵循下面的说明 −

从以下链接下载最新版的 Biopython − https://biopython.org/wiki/Download

到目前为止, 最新版本是 biopython-1.72 。

下载文件并解压压缩存档文件, 移到源代码文件夹并输入以下命令 −

这将从源代码构建 Biopython, 如下所示 −

现在, 使用以下命令测试代码 −

最后, 使用以下命令安装 −