Plotly 简明教程

Plotly - Quick Guide

Plotly - Introduction

Plotly 是一家位于蒙特利尔的科技公司,致力于开发诸如 DashChart Studio 一类的数据分析和可视化工具。此外,该公司还为 Python、R、MATLAB、JavaScript 和其他计算机编程语言开发了开源绘图应用程序编程接口 (API) 库。

Plotly 的某些 important features 如下 -

  1. It produces interactive graphs.

  2. 图表以 JavaScript 对象表示法 (JSON) data format 存储,以便可以使用其他编程语言(如 R、Julia、MATLAB 等)的脚本读取这些图表。

  3. 图表可以导出为各种栅格以及矢量图像格式。

Plotly - Environment Setup

本章重点介绍了如何在 Plotly 的帮助下完成 Python 中的环境设置。

Installation of Python package

强烈建议使用 Python 的虚拟环境功能来安装新包。以下命令在指定的文件夹中创建了一个虚拟环境。

python -m myenv

要激活创建的虚拟环境,请在 bin 子文件夹中运行 activate 脚本,如下所示。

source bin/activate

现在,我们可以使用 pip 实用工具如下安装 plotly 的 Python 包。

pip install plotly

你可能还希望安装 Jupyter notebook 应用程序,该应用程序是 Ipython 解释器的基于 Web 的接口。

pip install jupyter notebook

首先,你需要在以下网站上创建一个帐户: https://plot.ly 。你可以使用此处提及的链接 https://plot.ly/api_signup 注册,然后成功登录。

sign in page

接下来,从仪表板的设置页面获取 API 密钥。

settings page

使用你的用户名和 API 密钥设置 Python interpreter 会话中的凭据。

import plotly
plotly.tools.set_credentials_file(username='test',
api_key='********************')

一个名为 credentials 的特殊文件在你的主目录下的 .plotly subfolder 中创建。它看起来类似于以下内容:

{
   "username": "test",
   "api_key": "********************",
   "proxy_username": "",
   "proxy_password": "",
   "stream_ids": []
}

为了生成图表,我们需要从 plotly 包中导入以下模块:

import plotly.plotly as py
import plotly.graph_objs as go

plotly.plotly module 包含有助于与 Plotly 服务器通信的函数。 plotly.graph_objs module 中的函数生成图形对象

Plotly - Online and Offline Plotting

下一章介绍了在线和离线绘制的设置。让我们首先了解在线绘图的设置。

Settings for online plotting

Datagraph 联机图保存在您的 plot.ly account 中。联机图通过两种方法创建,它们两个都创建一个独特的 url 用作该图并将其保存在您的 Plotly 帐户中。

  1. py.plot() − 返回唯一的 URL 并可以选择性地打开该 URL。

  2. py.iplot() − 在 Jupyter Notebook 中工作时在笔记本中显示该图。

我们现在将在 radians vs. its sine value 中显示一个简单的角度图。首先,使用 numpy 库中的 arange() 函数获得 0 到 2π 之间的角度 ndarray 对象。此 ndarray 对象用作图形 x axis 上的值。需要显示在 y axis 上的角度的对应正弦值通过以下陈述获得 −

import numpy as np
import math #needed for definition of pi
xpoints = np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
ypoints = np.sin(xpoints)

接下来,使用 graph_objs module 中的 Scatter() 函数创建一个散布轨迹。

trace0 = go.Scatter(
   x = xpoints,
   y = ypoints
)
data = [trace0]

将上述列表对象用作 plot() 函数的参数。

py.plot(data, filename = 'Sine wave', auto_open=True)

将以下脚本保存为 plotly1.py

import plotly
plotly.tools.set_credentials_file(username='lathkar', api_key='********************')
import plotly.plotly as py
import plotly.graph_objs as go
import numpy as np
import math #needed for definition of pi

xpoints = np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
ypoints = np.sin(xpoints)
trace0 = go.Scatter(
   x = xpoints, y = ypoints
)
data = [trace0]
py.plot(data, filename = 'Sine wave', auto_open=True)

从命令行执行上述脚本。生成的图形将按如下所示在浏览器中以指定的 URL 显示。

$ python plotly1.py
High five! You successfully sent some data to your account on plotly.
View your plot in your browser at https://plot.ly/~lathkar/0
plot graph

就在显示的图形上方,您将发现标签 Plot、Data、Python 和 Rand Forking History。

当前, Plot tab 被选中。Data 标签显示包含 x 和 y 数据点的网格。从 Python 和 R 标签,您可以在 Python、R、JSON、Matlab 等中查看与当前图形对应的代码。以下快照显示了上面生成的图形的 Python 代码 −

python code

Setting for Offline Plotting

Plotly 允许您生成离线图形并将其保存在本地机器上。 plotly.offline.plot() 函数会创建独立的 HTML,将其本地保存并在您的 Web 浏览器中打开。

Jupyter Notebook 中进行离线工作时,使用 plotly.offline.iplot() 在笔记本中显示图形。

Note − 离线绘图需要 Plotly 的 1.9.4+

更改脚本中的 plot() function 语句并运行。一个名为 temp-plot.html 的 HTML 文件将在本地创建并在 Web 浏览器中打开。

plotly.offline.plot(
   { "data": data,"layout": go.Layout(title = "hello world")}, auto_open = True)
offline plotting

Plotly - Plotting Inline with Jupyter Notebook

在本章中,我们将学习如何在 Jupyter Notebook 中执行内嵌绘图。

为了在笔记本中显示绘图,你需要按照如下所示初始化 Plotly 的笔记本模式 -

from plotly.offline import init_notebook_mode
init_notebook_mode(connected = True)

将其余脚本保持原样,并按下 Shift+Enter 运行笔记本单元格。绘图将在笔记本内部脱机显示。

import plotly
plotly.tools.set_credentials_file(username = 'lathkar', api_key = '************')
from plotly.offline import iplot, init_notebook_mode
init_notebook_mode(connected = True)

import plotly
import plotly.graph_objs as go
import numpy as np
import math #needed for definition of pi

xpoints = np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
ypoints = np.sin(xpoints)
trace0 = go.Scatter(
   x = xpoints, y = ypoints
)
data = [trace0]
plotly.offline.iplot({ "data": data,"layout": go.Layout(title="Sine wave")})

Jupyter Notebook 的输出如下所示 -

jupyter notebook

绘图输出显示 tool bar 中的 top right 。它包含用作 png, zoom in and out, box and lasso, select and hover. 下载的按钮

tool bar

Plotly - Package Structure

Plotly Python 程序包包含三个主要模块,如下所示 −

  1. plotly.plotly

  2. plotly.graph_objs

  3. plotly.tools

plotly.plotly module 包含需要 Plotly 服务器响应的函数。此模块中的函数是在本地机器和 Plotly 之间的接口。

plotly.graph_objs module 是最重要的模块,它包含构成所看图形的对象的所有类定义。定义了如下的图形对象 −

  1. Figure,

  2. Data,

  3. ayout,

  4. 诸如 Scatter, Box, Histogram 等不同的图形轨迹。

plotly module

所有图形对象都是用于生成和/或修改 Plotly 图形的每个功能的字典类和列表类对象。

plotly.tools module 包含许多有助于简化和增强 Plotly 体验的函数。此模块中定义了用于 subplot generation 、在 IPython notebooks 中嵌入 Plotly 图形、保存和检索凭据的函数。

图形由 plotly.graph_objs module 中定义的 Figure 类表示的 Figure 对象表示。其构造函数需要以下参数 −

import plotly.graph_objs as go
fig = go.Figure(data, layout, frames)

data 参数是在 Python 中的列表对象。它是想要绘制的所有轨迹的列表。轨迹只是我们给要绘制的数据集合起的名字。 trace 对象根据想要在绘制表面上显示数据的方式命名。

Plotly 提供许多轨迹对象,例如 scatter, bar, pie, heatmap 等。每个轨迹都由 graph_objs 函数中的相应函数返回。例如: go.scatter() 返回散点轨迹。

import numpy as np
import math #needed for definition of pi

xpoints=np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
ypoints=np.sin(xpoints)

trace0 = go.Scatter(
   x = xpoints, y = ypoints
)
data = [trace0]

layout 参数定义了图形的外观和与数据无关的图表功能。因此我们将能够更改标题、轴标题、注释、图例、间距、字体甚至在图表顶部绘制形状等内容。

layout = go.Layout(title = "Sine wave", xaxis = {'title':'angle'}, yaxis = {'title':'sine'})

图形可以有 plot title 以及轴 title 。它也可以有注释来表示其他描述。

最后,有一个由 go.Figure() function 创建的 Figure object 。它是一个类似字典的对象,包含数据对象和布局对象。最后,将绘制图形对象。

py.iplot(fig)

Plotly - Exporting to Static Images

离线图形的输出可以导出为各种光栅和矢量图像格式。为此,我们需要安装两个依赖关系 – orcapsutil

Orca

Orca 代表 Open-source Report Creator App 。它是一个 Electron 应用,用于从命令行生成 plotly 图形、控制面板应用和控制面板的图像和报告。Orca 是 Plotly 的 Image Server 的支柱。

psutil

psutil (python system and process utilities) 是一个跨平台库,用于在 Python 中检索正在运行的进程和系统利用率的信息。它实现了 UNIX 命令行工具提供的许多功能,如: ps, top, netstat, ifconfig, who, 等。psutil 支持所有主要的运营系统,如 Linux、Windows 和 MacOs

Installation of Orca and psutil

如果您使用的是 Python 的 Anaconda 发行版,通过 conda package manager 可以非常容易地安装 orca 和 psutil,如下所示 −

conda install -c plotly plotly-orca psutil

因为 orca 在 PyPi 存储库中不可用。您可以使用 npm utility 来替代安装它。

npm install -g electron@1.8.4 orca

使用 pip 安装 psutil

pip install psutil

如果你无法使用 npm 或 conda,也可以从以下可通过 https://github.com/plotly/orca/releases. 获得的网站上下载 orca 的预构建二进制文件

要以 png、jpg 或 WebP 格式导出 Figure 对象,首先导入 plotly.io 模块

import plotly.io as pio

现在,我们可以按如下所示调用 write_image() 函数 −

pio.write_image(fig, ‘sinewave.png’)
pio.write_image(fig, ‘sinewave.jpeg’)
pio.write_image(fig,’sinewave.webp)

orca 工具还支持将 plotly 导出为 svg、pdf 和 eps 格式。

Pio.write_image(fig, ‘sinewave.svg’)
pio.write_image(fig, ‘sinewave.pdf’)

Jupyter notebook 中,通过 pio.to_image() 函数获得的图像对象可以按如下所示内联显示 −

jupyter notebook image

Plotly - Legends

默认情况下,具有多个迹线的 Plotly 图表会自动显示图例。如果它只有一个迹线,则不会自动显示。若要显示,请将 Layout 对象的 showlegend 参数设置为 True。

layout = go.Layoyt(showlegend = True)

图例的默认标签是迹线对象名称。若要显式设置图例标签,请设置迹线的名称属性。

在以下示例中,绘制了两个带有名称属性的散点迹线。

import numpy as np
import math #needed for definition of pi

xpoints = np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
y1 = np.sin(xpoints)
y2 = np.cos(xpoints)
trace0 = go.Scatter(
   x = xpoints,
   y = y1,
   name='Sine'
)
trace1 = go.Scatter(
   x = xpoints,
   y = y2,
   name = 'cos'
)
data = [trace0, trace1]
layout = go.Layout(title = "Sine and cos", xaxis = {'title':'angle'}, yaxis = {'title':'value'})
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

该图外观如下 −

legends trace object

Plotly - Format Axis and Ticks

您可以通过指定线条宽度和颜色来配置每个轴的外观。也可以定义网格宽度和网格颜色。让我们在这章中详细了解相同的内容。

Plot with Axis and Tick

在布局对象的属性中,将 showticklabels 设置为 true 将启用刻度。tickfont 属性是一个 dict 对象,用于指定字体名称、大小、颜色等。tickmode 属性有两个可能的值 - 线性和数组。如果是线性,则起始刻度的坐标由 tick0 确定,而刻度之间的步长由 dtick 属性确定。

如果将 tickmode 设置为数组,则必须提供值的列表,并将其作为 tickvalticktext 属性。

布局对象还具有 Exponentformat 属性,将其设置为 ‘e’ 将导致刻度值以科学记数法显示。您还需要将 showexponent 属性设置为 ‘all’

现在我们在上述示例中设置布局对象,通过指定线、网格和标题字体属性以及刻度模式、值和字体来配置 x 和 y axis

layout = go.Layout(
   title = "Sine and cos",
   xaxis = dict(
      title = 'angle',
      showgrid = True,
      zeroline = True,
      showline = True,
      showticklabels = True,
      gridwidth = 1
   ),
   yaxis = dict(
      showgrid = True,
      zeroline = True,
      showline = True,
      gridcolor = '#bdbdbd',
      gridwidth = 2,
      zerolinecolor = '#969696',
      zerolinewidth = 2,
      linecolor = '#636363',
      linewidth = 2,
      title = 'VALUE',
      titlefont = dict(
         family = 'Arial, sans-serif',
         size = 18,
         color = 'lightgrey'
      ),
      showticklabels = True,
      tickangle = 45,
      tickfont = dict(
      family = 'Old Standard TT, serif',
      size = 14,
      color = 'black'
      ),
      tickmode = 'linear',
      tick0 = 0.0,
      dtick = 0.25
   )
)
plot with axis and tick

Plot with Multiple Axes

有时,在图形中同时使用 x or y axes 很有用;例如,在用不同单位绘制曲线时。Matplotlib 通过 twinxtwiny 函数支持此功能。在以下示例中,绘图具有 dual y axes ,一个显示 exp(x) ,另一个显示 log(x)

x = np.arange(1,11)
y1 = np.exp(x)
y2 = np.log(x)
trace1 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y1,
   name = 'exp'
)
trace2 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y2,
   name = 'log',
   yaxis = 'y2'
)
data = [trace1, trace2]
layout = go.Layout(
   title = 'Double Y Axis Example',
   yaxis = dict(
      title = 'exp',zeroline=True,
      showline = True
   ),
   yaxis2 = dict(
      title = 'log',
      zeroline = True,
      showline = True,
      overlaying = 'y',
      side = 'right'
   )
)
fig = go.Figure(data=data, layout=layout)
iplot(fig)

这里,附加的 y 轴配置为 yaxis2 ,并出现在右侧,标题为 ‘log’ 。生成的绘图如下 −

plot with multiple axes

Plotly - Subplots and Inset Plots

在此,我们将理解 Plotly 中子图和插图的概念。

Making Subplots

有时候,并排比较数据的不同视图很有用。它支持子图的概念。它在 plotly.tools module 中提供 make_subplots() 函数。该函数返回一个 Figure 对象。

以下语句在一个行中创建两个子图。

fig = tools.make_subplots(rows = 1, cols = 2)

现在,我们可以将两个不同的轨迹(上面的示例中的 exp 和 log 轨迹)添加到该图形。

fig.append_trace(trace1, 1, 1)
fig.append_trace(trace2, 1, 2)

图表的布局通过使用 update() 方法指定 title, width, height, 等进一步配置。

fig['layout'].update(height = 600, width = 800s, title = 'subplots')

完整脚本如下−

from plotly import tools
import plotly.plotly as py
import plotly.graph_objs as go
from plotly.offline import iplot, init_notebook_mode
init_notebook_mode(connected = True)
import numpy as np
x = np.arange(1,11)
y1 = np.exp(x)
y2 = np.log(x)
trace1 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y1,
   name = 'exp'
)
trace2 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y2,
   name = 'log'
)
fig = tools.make_subplots(rows = 1, cols = 2)
fig.append_trace(trace1, 1, 1)
fig.append_trace(trace2, 1, 2)
fig['layout'].update(height = 600, width = 800, title = 'subplot')
iplot(fig)

这是绘图网格的格式:[(1,1) x1,y1][(1,2) x2,y2]

making subplots

Inset Plots

若要将子图显示为插图,我们需要配置其轨迹对象。首先,将插图轨迹的 xaxis 和 yaxis 属性分别配置为 ‘x2’‘y2’ 。以下语句将 ‘log’ 轨迹放入插图。

trace2 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y2,
   xaxis = 'x2',
   yaxis = 'y2',
   name = 'log'
)

其次,配置布局对象,其中插图的 x 和 y 轴位置由 domain 属性定义,该属性指定其与主轴相关的位置。

xaxis2=dict(
   domain = [0.1, 0.5],
   anchor = 'y2'
),
yaxis2 = dict(
   domain = [0.5, 0.9],
   anchor = 'x2'
)

在插图中显示 log 轨迹并在主轴上显示 exp 轨迹的完整脚本如下:

trace1 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y1,
   name = 'exp'
)
trace2 = go.Scatter(
   x = x,
   y = y2,
   xaxis = 'x2',
   yaxis = 'y2',
   name = 'log'
)
data = [trace1, trace2]
layout = go.Layout(
   yaxis = dict(showline = True),
   xaxis2 = dict(
      domain = [0.1, 0.5],
      anchor = 'y2'
   ),
   yaxis2 = dict(
      showline = True,
      domain = [0.5, 0.9],
      anchor = 'x2'
   )
)
fig = go.Figure(data=data, layout=layout)
iplot(fig)

输出如下:

inset plots

Plotly - Bar Chart and Pie Chart

在本章中,我们将学习如何借助 Plotly 制作条形图和饼图。让我们从了解条形图开始。

Bar Chart

条形图使用与其所表示的值成比例的矩形条以显示分类数据,这些条形图具有高度或长度。条形图可以垂直或水平显示。它有助于显示离散类别之间的比较。图表的一条轴显示正在比较的特定类别,另一条轴表示测量值。

以下示例针对不同课程注册的学生人数绘制了一个简单的 bar chartgo.Bar() 函数返回一个条形轨迹,其中 x 坐标设置为科目列表,y 坐标设置为学生人数。

import plotly.graph_objs as go
langs = ['C', 'C++', 'Java', 'Python', 'PHP']
students = [23,17,35,29,12]
data = [go.Bar(
   x = langs,
   y = students
)]
fig = go.Figure(data=data)
iplot(fig)

输出将如下所示 −

bar chart

要显示分组条形图,必须将 Layout 对象的 barmode 属性设置为 group 。在以下代码中,表示每个年级学生的多个轨迹相对于科目进行绘制,并显示为分组条形图。

branches = ['CSE', 'Mech', 'Electronics']
fy = [23,17,35]
sy = [20, 23, 30]
ty = [30,20,15]
trace1 = go.Bar(
   x = branches,
   y = fy,
   name = 'FY'
)
trace2 = go.Bar(
   x = branches,
   y = sy,
   name = 'SY'
)
trace3 = go.Bar(
   x = branches,
   y = ty,
   name = 'TY'
)
data = [trace1, trace2, trace3]
layout = go.Layout(barmode = 'group')
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

其输出如下 −

grouped bar chart

barmode 属性确定在图形上如何显示具有相同位置坐标的条形图。定义的值为“堆叠”(条形图彼此堆叠),“相对”(条形图彼此堆叠,负值在轴下方,正值在轴上方),“ group ”(条形图彼此相邻绘制)。

通过将 barmode 属性更改为“ stack ”,绘制的图形如下所示 −

stack plotted graph

Pie chart

饼图仅显示一个数据序列。 Pie Charts 显示一个数据序列中项目(称为 wedge )的大小,它与项目的总和成比例。数据点显示为整个饼图的百分比。

graph_objs 模块中的 pie() 函数 - go.Pie() 返回一个饼图轨迹。两个必需参数是 labelsvalues 。让我们绘制一个简单的语言课程与学生人数的饼图,如以下示例所示。

import plotly
plotly.tools.set_credentials_file(
   username = 'lathkar', api_key = 'U7vgRe1hqmRp4ZNf4PTN'
)
from plotly.offline import iplot, init_notebook_mode
init_notebook_mode(connected = True)
import plotly.graph_objs as go
langs = ['C', 'C++', 'Java', 'Python', 'PHP']
students = [23,17,35,29,12]
trace = go.Pie(labels = langs, values = students)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

在 Jupyter Notebook 中显示如下输出 -

pie chart

Donut chart 是一个圆心带一个圆孔的饼图,这使它看起来像一个甜甜圈。在以下示例中,两个甜甜圈图以 1X2 网格布局显示。虽然“ label ”布局对两个饼形迹线相同,但每一部分情节的行和列目的地由域属性决定。

为此,我们使用 2019 年议会选举中按党派划分的席位和得票率数据。在 Jupyter Notebook 单元格中输入以下代码 -

parties = ['BJP', 'CONGRESS', 'DMK', 'TMC', 'YSRC', 'SS', 'JDU','BJD', 'BSP','OTH']
seats = [303,52,23,22,22,18,16,12,10, 65]
percent = [37.36, 19.49, 2.26, 4.07, 2.53, 2.10, 1.46, 1.66, 3.63, 25.44]
import plotly.graph_objs as go
data1 = {
   "values": seats,
   "labels": parties,
   "domain": {"column": 0},
   "name": "seats",
   "hoverinfo":"label+percent+name",
   "hole": .4,
   "type": "pie"
}
data2 = {
   "values": percent,
   "labels": parties,
   "domain": {"column": 1},
   "name": "vote share",
   "hoverinfo":"label+percent+name",
   "hole": .4,
   "type": "pie"
}
data = [data1,data2]
layout = go.Layout(
   {
      "title":"Parliamentary Election 2019",
      "grid": {"rows": 1, "columns": 2},
      "annotations": [
         {
            "font": {
               "size": 20
            },
            "showarrow": False,
            "text": "seats",
            "x": 0.20,
            "y": 0.5
         },
         {
            "font": {
               "size": 20
            },
            "showarrow": False,
            "text": "votes",
            "x": 0.8,
            "y": 0.5
         }
      ]
   }
)
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

如下给出相同代码的输出结果 -

donut chart

Scatter Plot, Scattergl Plot and Bubble Charts

本章重点介绍散点图、Scattergl 图和气泡图的详细信息。首先,让我们探讨散点图。

Scatter Plot

散点图用于将点 plot data 在水平轴和垂直轴上,以展示一个变量如何影响另一个变量。数据表中的每一行都用一个标记表示,其位置取决于其在 XY 轴上设置的列中的值。

graph_objs 模块 (go.Scatter)scatter() 方法产生一个散点轨迹。此处, mode 属性决定了数据点的外观。模式的默认值为 lines,显示连接数据点的连续线。如果设置为 markers ,则只显示由小空心圆点表示的数据点。当模式指定为“lines+markers”时,则显示圆形和线。

在以下示例中,绘制了笛卡尔坐标系中三组随机生成点的散点轨迹。下面解释了每条轨迹显示的不同的模式属性。

import numpy as np
N = 100
x_vals = np.linspace(0, 1, N)
y1 = np.random.randn(N) + 5
y2 = np.random.randn(N)
y3 = np.random.randn(N) - 5
trace0 = go.Scatter(
   x = x_vals,
   y = y1,
   mode = 'markers',
   name = 'markers'
)
trace1 = go.Scatter(
   x = x_vals,
   y = y2,
   mode = 'lines+markers',
   name = 'line+markers'
)
trace2 = go.Scatter(
   x = x_vals,
   y = y3,
   mode = 'lines',
   name = 'line'
)
data = [trace0, trace1, trace2]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

Jupyter notebook cell 的输出如下所示:

jupyter notebook cell

Scattergl Plot

WebGL (网络图形库)是一个 JavaScript API,用于在任何兼容的网络浏览器中呈现交互式 2D3D graphics ,而无需使用插件。WebGL 与其他网络标准完全集成,允许图形处理单元 (GPU) 加速使用图像处理。

Plotly 您可以使用 Scattergl() 代替 Scatter() 实现 WebGL,以提高速度、改善交互性,并绘制更多数据的能力。 go.scattergl() 函数在涉及大量数据点时可以提供更好的性能。

import numpy as np
N = 100000
x = np.random.randn(N)
y = np.random.randn(N)
   trace0 = go.Scattergl(
   x = x, y = y, mode = 'markers'
)
data = [trace0]
layout = go.Layout(title = "scattergl plot ")
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

输出如下:

scattergl plot

Bubble charts

气泡图显示数据的三个维度。具有关联数据的三个维度的每个实体均绘为一个 disk (气泡),它通过圆盘的 xy location 表示两个维度,并通过其大小表示第三个维度。气泡的大小由第三个数据序列中的值决定。

Bubble chart 是散点图的一种变化形式,其中数据点用气泡代替。如果你的数据包含三个维度,如下所示,则创建一个气泡图是一个不错的选择。

Company

Products

Sale

Share

A

13

2354

23

B

6

5423

47

C

23

2451

30

气泡图用 go.Scatter() 迹生成。以上两个数据序列中的 productssale 用 作 xy 属性,而 market share 作为 marker size

在 Jupyter 笔记本中输入以下代码。

company = ['A','B','C']
products = [13,6,23]
sale = [2354,5423,4251]
share = [23,47,30]
fig = go.Figure(data = [go.Scatter(
   x = products, y = sale,
   text = [
      'company:'+c+' share:'+str(s)+'%'
      for c in company for s in share if company.index(c)==share.index(s)
   ],
   mode = 'markers',
   marker_size = share, marker_color = ['blue','red','yellow'])
])
iplot(fig)

输出应如下所示 −

bubble chart

Plotly - Dot Plots and Table

此处,我们将了解 Plotly 中的点图和 table 函数。首先,让我们从点图开始。

Dot Plots

点图在非常简单的刻度上显示点。它仅适合于少量的点,因为大量的点会使点图显得过于杂乱不清。点图还被称为 Cleveland dot plots 。它们显示两个(或更多个)时间点或两个(或更多个)条件之间的变化。

点图类似于水平条形图。然而,它们不会显得过于杂乱不清,并且允许更容易地在条件之间进行比较。该图形绘制了散点迹线,并将 mode 属性设置为 markers。

以下示例显示了在印度独立后每次人口普查中记录的男性和女性之间的识字率比较。图表中的两条迹线表示 1951 年至 2011 年期间每次人口普查中的男性和女性识字率百分比。

from plotly.offline import iplot, init_notebook_mode
init_notebook_mode(connected = True)
census = [1951,1961,1971,1981,1991,2001, 2011]
x1 = [8.86, 15.35, 21.97, 29.76, 39.29, 53.67, 64.63]
x2 = [27.15, 40.40, 45.96, 56.38,64.13, 75.26, 80.88]
traceA = go.Scatter(
   x = x1,
   y = census,
   marker = dict(color = "crimson", size = 12),
   mode = "markers",
   name = "Women"
)
traceB = go.Scatter(
x = x2,
y = census,
marker = dict(color = "gold", size = 12),
mode = "markers",
name = "Men")
data = [traceA, traceB]
layout = go.Layout(
   title = "Trend in Literacy rate in Post independent India",
   xaxis_title = "percentage",
   yaxis_title = "census"
)
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

输出应如下所示 −

cleveland dot plots

Table in Plotly

Plotly 的 Table 对象由 go.Table() 函数返回。表格迹线是一种图形对象,可用于以行和列的网格方式查看详细数据。表格使用按列优先的顺序,即网格表示为列向量的向量。

go.Table() 函数的两个重要参数是 header ,即表格的第一行,以及 cells ,即其余行。两个参数均为字典对象。标题的 values 属性是列标题的列表,以及列表的列表,每个列表对应于一行。

通过 linecolor、fill_color、font 和其他属性进一步定制样式。

以下代码显示了最近结束的 2019 年板球世界杯小组循环赛的积分表。

trace = go.Table(
   header = dict(
      values = ['Teams','Mat','Won','Lost','Tied','NR','Pts','NRR'],
      line_color = 'gray',
      fill_color = 'lightskyblue',
      align = 'left'
   ),
   cells = dict(
      values =
      [
         [
            'India',
            'Australia',
            'England',
            'New Zealand',
            'Pakistan',
            'Sri Lanka',
            'South Africa',
            'Bangladesh',
            'West Indies',
            'Afghanistan'
         ],
         [9,9,9,9,9,9,9,9,9,9],
         [7,7,6,5,5,3,3,3,2,0],
         [1,2,3,3,3,4,5,5,6,9],
         [0,0,0,0,0,0,0,0,0,0],
         [1,0,0,1,1,2,1,1,1,0],
         [15,14,12,11,11,8,7,7,5,0],
         [0.809,0.868,1.152,0.175,-0.43,-0.919,-0.03,-0.41,-0.225,-1.322]
      ],
      line_color='gray',
      fill_color='lightcyan',
      align='left'
   )
)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

输出如下所述 −

表格数据还可以从 Pandas 数据框中填充。我们按如下所示创建一个逗号分隔文件 ( points-table.csv ) −

Teams

Mat

Won

Lost

Tied

NR

Pts

NRR

India

9

7

1

0

1

15

0.809

Australia

9

7

2

0

0

14

0.868

England

9

6

3

0

0

14

1.152

New Zealand

9

5

3

0

1

11

0.175

Pakistan

9

5

3

0

1

11

-0.43

Sri Lanka

9

3

4

0

2

8

-0.919

South Africa

9

3

5

0

1

7

-0.03

Bangladesh

9

3

5

0

1

7

-0.41

Teams,Matches,Won,Lost,Tie,NR,Points,NRR
India,9,7,1,0,1,15,0.809
Australia,9,7,2,0,0,14,0.868
England,9,6,3,0,0,12,1.152
New Zealand,9,5,3,0,1,11,0.175
Pakistan,9,5,3,0,1,11,-0.43
Sri Lanka,9,3,4,0,2,8,-0.919
South Africa,9,3,5,0,1,7,-0.03
Bangladesh,9,3,5,0,1,7,-0.41
West Indies,9,2,6,0,1,5,-0.225
Afghanistan,9,0,9,0,0,0,-1.322

我们现在从此 csv 文件中构建一个数据框对象,并使用它按如下所示构建表格迹线 −

import pandas as pd
df = pd.read_csv('point-table.csv')
trace = go.Table(
   header = dict(values = list(df.columns)),
   cells = dict(
      values = [
         df.Teams,
         df.Matches,
         df.Won,
         df.Lost,
         df.Tie,
         df.NR,
         df.Points,
         df.NRR
      ]
   )
)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

Plotly - Histogram

直方图由卡尔·皮尔森引入,是数字数据分布的准确表示,即连续变量概率分布的估计值(CORAL)。它看起来类似于条形图,但是,条形图关联两个变量,而直方图仅关联一个变量。

直方图需要 bin (或 bucket ),它将整个值范围分成一系列区间,然后统计落在每个区间中的值的个数。这些直方通常指定为变量的连续、不重叠的区间。这些直方必须相邻,并且通常具有相同的大小。在直方上面竖起一个矩形,其高度与频率成正比,即每个直方中的情况数。

Plotly 函数返回直方图跟踪对象。它的定制由各种参数或属性完成。一个基本参数是 x 或 y,设置到以下列表中: numpy arrayPandas dataframe object ,它要以 bin 方式分布。

默认情况下,Plotly 以自动调整大小的 bin 方式分布数据点。但是,您可以定义自定义 bin 大小。为此,您需要将 autobins 设为 false,指定 nbins (bin 的数量)、它的起始值、结束值和大小。

下列代码生成一个简单的直方图,在 bin 中显示一班学生成绩分布(自动调整大小)−

import numpy as np
x1 = np.array([22,87,5,43,56,73,55,54,11,20,51,5,79,31,27])
data = [go.Histogram(x = x1)]
fig = go.Figure(data)
iplot(fig)

输出如下所示:

histnorm

go.Histogram() 函数接受 histnorm ,它指定用于此直方图跟踪的正态化类型。默认值是 “”,每个条的范围对应于出现的次数(即位于 bin 内的数据点的数量)。如果将它赋值给 "percent" / "probability" ,则每个条的范围对应于相对于样本点总数出现的百分比/分数。如果它等于 “ density ”,则每个条的范围对应于位于 bin 中出现的次数除以 bin 间隔的大小。

此外还有 histfunc 参数,其默认值是 count 。结果,位于 bin 上的矩形的高度对应于数据点的计数。它可以设为 sum、avg、min 或 max。

可以将 histogram() 函数设为显示连续 bin 中值的累积分布。为此,您需要将 cumulative property 设为 enabled。结果如下所示 −

data=[go.Histogram(x = x1, cumulative_enabled = True)]
fig = go.Figure(data)
iplot(fig)

输出如下所述 −

cumulative property

Plotly - Box Plot Violin Plot and Contour Plot

本章重点介绍了对包括箱形图、小提琴图、轮廓图和颤动图在内的各种图表的详细理解。最初,我们将从箱形图开始。

Box Plot

箱形图显示了一组数据的摘要,包括最小值、 first quartile, median, third quartilemaximum 。在箱形图中,我们从第一个四分位数到第三个四分位数画一个框。一条垂直线在中位数处通过该框。从框垂直延伸出来的线表示上下四分位数外的可变性,称为晶须。因此,箱形图也称为箱形图和 whisker plot 。晶须从每个四分位数延伸到最小值或最大值。

box plot

要绘制箱形图,我们必须使用 go.Box() 函数。可以将数据序列分配给 x 或 y 参数。相应地,箱形图将水平或垂直绘制。在以下示例中,某公司不同分公司的销售数据转换成水平箱形图。它显示了最小值和最大值的中位数。

trace1 = go.Box(y = [1140,1460,489,594,502,508,370,200])
data = [trace1]
fig = go.Figure(data)
iplot(fig)

输出如下所示:

boxpoints parameter

可以给 go.Box() 函数各种其他参数来控制箱形图的外观和行为。其中之一是 boxmean 参数。

boxmean 参数默认设置为 true。结果,箱的基本分布的平均值在箱内绘制为虚线。如果将其设置为 sd,则还绘制分布的标准差。

boxpoints 参数默认等于 " outliers "。仅显示晶须外的样本点。如果为 "suspectedoutliers",则显示异常点,并突出显示小于 4"Q1-3"Q3 或大于 4"Q3-3"Q1 的点。如果为 "False",则仅显示箱(es),而不显示样本点。

在以下示例中, box trace 使用标准差和异常点绘制。

trc = go.Box(
   y = [
      0.75, 5.25, 5.5, 6, 6.2, 6.6, 6.80, 7.0, 7.2, 7.5, 7.5, 7.75, 8.15,
      8.15, 8.65, 8.93, 9.2, 9.5, 10, 10.25, 11.5, 12, 16, 20.90, 22.3, 23.25
   ],
   boxpoints = 'suspectedoutliers', boxmean = 'sd'
)
data = [trc]
fig = go.Figure(data)
iplot(fig)

输出如下所示:

box trace

Violin Plot

小提琴图类似于箱形图,不同之处在于它们还显示了不同值处数据的概率密度。与标准箱形图一样,小提琴图将包括一个表示数据中位数的标记和一个表示四分位间范围的框。在这个箱形图上叠加的是核密度估计。与箱形图一样,小提琴图用于表示不同“类别”中变量分布(或样本分布)的比较。

小提琴图比普通箱形图更具信息性。事实上,虽然箱形图仅显示平均值/中位数和四分位数范围等汇总统计数据,但小提琴图显示了 full distribution of the data

go.Violin() 函数在 graph_objects 模块中返回小提琴迹对象。为了显示基础箱形图,将 boxplot_visible 属性设置为 True。类似地,通过将 meanline_visible 属性设置为 true,可以在小提琴内部显示对应于样本平均值的线。

以下示例演示如何使用 Plotly 的功能显示小提琴图。

import numpy as np
np.random.seed(10)
c1 = np.random.normal(100, 10, 200)
c2 = np.random.normal(80, 30, 200)
trace1 = go.Violin(y = c1, meanline_visible = True)
trace2 = go.Violin(y = c2, box_visible = True)
data = [trace1, trace2]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

输出如下 −

violin plot

Contour plot

二维等值线图显示二维数值数组 z 的轮廓线,即 z 的 isovalues 插值线。双变量函数的等值线是函数具有常数值的曲线,使得曲线连接等值点。

如果你想了解某个值 Z 如何随着两个输入值 XY 变化而变化(即 Z = f(X,Y) ),那么轮廓图非常合适。双变量函数的等值线或等值线是函数具有常数值的曲线。

自变量 x 和 y 通常限制在一个称为网格的规则网格中。numpy.meshgrid 由一个 x 值数组和一个 y 值数组创建一个矩形网格。

让我们首先使用 Numpy 库中的 linspace() 函数创建 x、y 和 z 的数据值。我们从 x 和 y 值创建 meshgrid ,并获取由 x2+y2 平方根组成的 z 数组

我们在 graph_objects 模块中有一个 go.Contour() 函数,它获取 x、 yz 属性。以下代码片段显示了上述计算的 x、 yz 值的轮廓图。

import numpy as np
xlist = np.linspace(-3.0, 3.0, 100)
ylist = np.linspace(-3.0, 3.0, 100)
X, Y = np.meshgrid(xlist, ylist)
Z = np.sqrt(X**2 + Y**2)
trace = go.Contour(x = xlist, y = ylist, z = Z)
data = [trace]
fig = go.Figure(data)
iplot(fig)

输出如下 −

contour plot

轮廓图可以通过一个或多个以下参数自定义 −

  1. Transpose (boolean) − 对 z 数据进行转置。

如果 xtype (或 ytype )等于“array”,则 x/y 坐标由“x”/“y”给出。如果“scaled”,则 x 坐标由“x0”和“ dx ”给出。

  1. connectgaps 参数确定是否填充 z 数据中的空白。

  2. ncontours 参数的默认值为 15。实际轮廓线数量将自动选择为小于或等于 ncontours 的值。仅在 autocontour 为“True”时有效。

轮廓类型默认值为“ levels ”,因此数据表示为显示多级的轮廓图。如果 constrain ,数据将表示为约束,无效区域按照 operationvalue 参数指定的着色。

showlines − 确定是否绘制轮廓线。

zauto 默认情况下为 True ,确定是否根据输入数据(此处为 z )来计算颜色域,或根据 zminzmax 中设置的边界。当 zminzmax 由用户设置时,默认为 False

Quiver plot

羽状图也称为 velocity plot 。它以箭头形式显示速度向量,箭头组件为 ( u,v ) 在点 (x,y)。为了绘制羽状图,我们将使用在 Plotly 的 figure_factory 模块中定义的 create_quiver() 函数。

Plotly 的 Python API 包含一个图形工厂模块,其中包含许多包装函数,这些函数创建了独特的图表类型,这些图表类型尚未包含在 plotly.js 中,Plotly 的开源绘图库。

create_quiver() 函数接受以下参数 −

  1. x − 箭头的 x 坐标

  2. y − 箭头的 y 坐标

  3. u − 箭头向量的 x 分量

  4. v − 箭头向量的 y 分量

  5. scale − 缩放箭头大小

  6. arrow_scale − 箭头长度

  7. angle − 箭头角度

以下代码在 Jupyter notebook 中呈现一个简单的箭簇图 −

import plotly.figure_factory as ff
import numpy as np
x,y = np.meshgrid(np.arange(-2, 2, .2), np.arange(-2, 2, .25))
z = x*np.exp(-x**2 - y**2)
v, u = np.gradient(z, .2, .2)

# Create quiver figure
fig = ff.create_quiver(x, y, u, v,
scale = .25, arrow_scale = .4,
name = 'quiver', line = dict(width = 1))
iplot(fig)

代码的输出如下 −

quiver plot

Plotly - Distplots Density Plot and Error Bar Plot

在本章中,我们将详细了解 distplot、密度图和误差棒图。让我们从了解 distplot 开始。

Distplots

distplot 图表工厂显示数值数据的统计表示组合形式,例如直方图、核密度估计或正态曲线,以及 rug 图。

distplot 可以由以下 3 个组件的全部或任意组合组成 −

  1. histogram

  2. curve:(a)核密度估计或(b)正态分布,以及

  3. rug plot

figure_factory 模块具有 create_distplot() 函数,需要称为 hist_data 的强制参数。

以下代码创建一个基本 distplot,它包含一个直方图、一个 kde 图和一个 rug 图。

x = np.random.randn(1000)
hist_data = [x]
group_labels = ['distplot']
fig = ff.create_distplot(hist_data, group_labels)
iplot(fig)

以上提到的这段代码的输出内容如下 −

distplots

Density Plot

密度图是根据数据估计出的直方图的平滑连续版本。最常见的估计形式称为 kernel density estimation (KDE) 。在此方法中,在每个单独数据点上绘制一个连续曲线(核),然后将所有这些曲线加在一起以进行单次平滑密度估计。

模块 plotly.figure_factory._2d_density 中的 create_2d_density() 函数返回用于二维密度图的图表对象。

以下代码用于根据直方图数据生成二维密度图。

t = np.linspace(-1, 1.2, 2000)
x = (t**3) + (0.3 * np.random.randn(2000))
y = (t**6) + (0.3 * np.random.randn(2000))
fig = ff.create_2d_density( x, y)
iplot(fig)

下面提及的内容是以上给出的代码的输出。

density plot

Error Bar Plot

误差棒是数据中误差或不确定性的图形化表示,它们有助于正确的解释。出于科学目的,理解给出数据时报告误差至关重要。

误差棒对解决问题者十分有用,因为误差棒显示出一组测量或计算值中的置信度或精确度。

错误线通常表示数据集的范围和标准差。它们可以帮助显示数据如何围绕平均值分布。可以在各种绘图上生成错误线,例如条形图、折线图、散点图等。

go.Scatter() 函数具有 error_xerror_y 属性,用于控制如何生成错误线。

  1. visible (boolean) − 确定这组错误线是否可见。

Type 属性具有可能取值 " percent " | " constant " | " sqrt " | data ”。它设置用于生成错误线的规则。如果为 "percent",则条形长度对应于基础数据的百分比。在 value 中设置此百分比。如果为 "sqrt",则条形长度对应于基础数据的平方。如果为 "data",则条形长度使用数据集 array 设置。

  1. symmetric 属性可以为 true 或 false。因此,错误线将具有相同长度,且方向相同或不同(垂直条形的顶部/底部,水平条形的左右)。

  2. array − 设置对应于每个错误线长度的数据。值相对于基础数据绘制。

  3. arrayminus − 设置对应于每个错误线长度的数据,针对垂直(水平)条形底部(左侧)方向。相对于基础数据绘制值。

以下代码在散点图上显示对称错误线 −

trace = go.Scatter(
   x = [0, 1, 2], y = [6, 10, 2],
   error_y = dict(
   type = 'data', # value of error bar given in data coordinates
   array = [1, 2, 3], visible = True)
)
data = [trace]
layout = go.Layout(title = 'Symmetric Error Bar')
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

下面给出上述代码的输出。

error bar plot

通过以下脚本渲染非对称错误图 −

trace = go.Scatter(
   x = [1, 2, 3, 4],
   y =[ 2, 1, 3, 4],
   error_y = dict(
      type = 'data',
      symmetric = False,
      array = [0.1, 0.2, 0.1, 0.1],
      arrayminus = [0.2, 0.4, 1, 0.2]
   )
)
data = [trace]
layout = go.Layout(title = 'Asymmetric Error Bar')
fig = go.Figure(data = data, layout = layout)
iplot(fig)

输出如下所示 −

asymmeric error bar

Plotly - Heatmap

热力图(或热图)是数据的图形化表示,其中数据集中包含的各个值表示为颜色。热图的主要目的是更好地可视化数据集中的位置/事件的数量,并帮助将查看者定向到数据可视化中最重要的地方。

由于热图依赖于颜色来传达值,因此它们最常用于显示数字值的概括视图。热图在吸引注意力时极其通用且高效,正因如此,它们在分析社区中变得越来越受欢迎。

热图本质上是不言自明的。阴影越深,数量越大(值越高,分散越紧密,依此类推)。Plotly 的 graph_objects 模块包含 Heatmap() 函数。它需要 x、 yz 属性。它们的值可以是列表、numpy 数组或 Pandas 数据框。

在以下示例中,我们有一个 2D 列表或数组,其中定义了需要着色的数据(不同农民每年收获的吨/年)。然后,我们还需要两个农民姓名和他们耕种的蔬菜名称列表。

vegetables = [
   "cucumber",
   "tomato",
   "lettuce",
   "asparagus",
   "potato",
   "wheat",
   "barley"
]
farmers = [
   "Farmer Joe",
   "Upland Bros.",
   "Smith Gardening",
   "Agrifun",
   "Organiculture",
   "BioGoods Ltd.",
   "Cornylee Corp."
]
harvest = np.array(
   [
      [0.8, 2.4, 2.5, 3.9, 0.0, 4.0, 0.0],
      [2.4, 0.0, 4.0, 1.0, 2.7, 0.0, 0.0],
      [1.1, 2.4, 0.8, 4.3, 1.9, 4.4, 0.0],
      [0.6, 0.0, 0.3, 0.0, 3.1, 0.0, 0.0],
      [0.7, 1.7, 0.6, 2.6, 2.2, 6.2, 0.0],
      [1.3, 1.2, 0.0, 0.0, 0.0, 3.2, 5.1],
      [0.1, 2.0, 0.0, 1.4, 0.0, 1.9, 6.3]
   ]
)
trace = go.Heatmap(
   x = vegetables,
   y = farmers,
   z = harvest,
   type = 'heatmap',
   colorscale = 'Viridis'
)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

上面提到的代码的输出如下 −

heatmap

Plotly - Polar Chart and Radar Chart

在本章中,我们将学习如何在 Plotly 的帮助下制作极坐标图和雷达图。

首先,让我们研究一下极坐标图。

Polar Chart

极坐标图是圆形图的常见变体。当数据点之间的关系最容易通过半径和角度可视化时,它非常有用。

在极坐标图中,一个序列由一个闭合曲线表示,该曲线连接了极坐标系中的点。每个数据点由到极点的距离(径向坐标)和到固定方向的角度(角坐标)确定。

极坐标图沿着径向轴和角轴表示数据。径向坐标和角坐标使用 go.Scatterpolar() 函数的 rtheta 参数给出。theta 数据可以是分类的,但数值数据也是可能的并且是最常用的。

以下代码生成一个基本的极坐标图。除了 r 和 theta 参数外,我们还将模式设置为 lines (它可以设置为标记,在这种情况下只显示数据点)。

import numpy as np
r1 = [0,6,12,18,24,30,36,42,48,54,60]
t1 = [1,0.995,0.978,0.951,0.914,0.866,0.809,0.743,0.669,0.588,0.5]
trace = go.Scatterpolar(
   r = [0.5,1,2,2.5,3,4],
   theta = [35,70,120,155,205,240],
   mode = 'lines',
)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

输出如下 −

polar chart

在以下示例中,来自 comma-separated values (CSV) file 的数据用于生成极坐标图。 polar.csv 的前几行如下 -

y,x1,x2,x3,x4,x5,
0,1,1,1,1,1,
6,0.995,0.997,0.996,0.998,0.997,
12,0.978,0.989,0.984,0.993,0.986,
18,0.951,0.976,0.963,0.985,0.969,
24,0.914,0.957,0.935,0.974,0.946,
30,0.866,0.933,0.9,0.96,0.916,
36,0.809,0.905,0.857,0.943,0.88,
42,0.743,0.872,0.807,0.923,0.838,
48,0.669,0.835,0.752,0.901,0.792,
54,0.588,0.794,0.691,0.876,0.74,
60,0.5,0.75,0.625,0.85,0.685,

在笔记本的输入单元中输入以下脚本以生成如下图所示的极坐标图 -

import pandas as pd
df = pd.read_csv("polar.csv")
t1 = go.Scatterpolar(
   r = df['x1'], theta = df['y'], mode = 'lines', name = 't1'
)
t2 = go.Scatterpolar(
   r = df['x2'], theta = df['y'], mode = 'lines', name = 't2'
)
t3 = go.Scatterpolar(
   r = df['x3'], theta = df['y'], mode = 'lines', name = 't3'
)
data = [t1,t2,t3]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

以下为上述代码的输出 -

generate polar chart

Radar chart

雷达图(也称为 spider plotstar plot ),以从中心向外发散的轴上表示的定量变量二维图的形式显示多变量数据。这些轴的相对位置和角度通常没有信息量。

对于雷达图,在一般情况下,使用具有 go.Scatterpolar() 函数中类别角变量的极坐标图。

以下代码可呈现具有 Scatterpolar() function 的基本雷达图 -

radar = go.Scatterpolar(
   r = [1, 5, 2, 2, 3],
   theta = [
      'processing cost',
      'mechanical properties',
      'chemical stability',
      'thermal stability',
      'device integration'
   ],
   fill = 'toself'
)
data = [radar]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

下面提到的输出是给定代码的结果 -

radar chart

OHLC Chart, Waterfall Chart and Funnel Chart

本章重点介绍了其他三种类型的图表,包括 OHLC、瀑布图和漏斗图,这些图表可以在 Plotly 的帮助下制作。

OHLC Chart

一种 open-high-low-close 图表(也称作 OHLC)是一种 bar chart ,通常用于说明诸如股票等金融工具价格的变动。OHLC 图表很有用,因为它们显示了一段期间内的四个主要数据点。这类图表之所以有用,是因为它可以显示上升或下降的动能。高点和低点数据对于评估波动很有用。

图表上的每条垂直线均显示一个时间单位(如一天或一小时)内的价格范围(最高价和最低价)。标号从每条线的两侧突出显示,左侧表示开盘价(例如,对于日线图,这将是该天的开盘价),右侧表示该时间段的收盘价。

下面显示了用于演示 OHLC 图表的示例数据。此数据具有与相应日期字符串相对应的代表高、低、开盘和收盘值的对象列表。使用 datetime 模块中的 strtp() 函数将字符串的日期表示转换为日期对象。

open_data = [33.0, 33.3, 33.5, 33.0, 34.1]
high_data = [33.1, 33.3, 33.6, 33.2, 34.8]
low_data = [32.7, 32.7, 32.8, 32.6, 32.8]
close_data = [33.0, 32.9, 33.3, 33.1, 33.1]
date_data = ['10-10-2013', '11-10-2013', '12-10-2013','01-10-2014','02-10-2014']
import datetime
dates = [
   datetime.datetime.strptime(date_str, '%m-%d-%Y').date()
   for date_str in date_data
]

必须使用上述日期对象作为 x 参数,以及 go.Ohlc() 函数所需的开盘、高、低和收盘参数,该函数返回 OHLC 轨迹。

trace = go.Ohlc(
   x = dates,
   open = open_data,
   high = high_data,
   low = low_data,
   close = close_data
)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

下面给出代码的输出 −

ohlc chart

Candlestick Chart

candlestick chart 与 OHLC 图表类似。它类似于 line-chartbar-chart 的组合。这些方框表示开盘价和收盘价之间的价差,而线段表示低价和高价之间的价差。收盘价高于(低于)开盘价的示例点被称为上升(下降)。

go.Candlestick() function 返回烛台轨迹。我们使用相同数据(与 OHLC 图表相同)来渲染烛台图,如下所示 -

trace = go.Candlestick(
   x = dates,
   open = open_data,
   high = high_data,
   low = low_data,
   close = close_data
)

以下是给定代码的输出 -

candlestick chart

Waterfall chart

瀑布图(也称为 flying bricks chart or Mario chart )有助于理解按顺序引入的正或负值(其可以基于时间或基于类别)的累积效应。

起始值和结束值显示为柱状图,各个负调整值和正调整值显示为浮动步长。一些瀑布图连接柱状图之间的线段,以使图表看起来像桥梁。

go.Waterfall() 函数返回一个瀑布追踪。该对象可以通过各种命名参数或属性进行定制。这里,x 和 y 属性设置了图形的 x 和 y 坐标的数据。两者都可以是 Python 列表、numpy 数组、Pandas 时间序列、字符串或日期时间对象。

另一个属性是 measure ,它是一个包含值类型的数组。默认情况下,这些值被认为是 relative 。将其设置为“total”以计算总和。如果它等于 absolute ,它会重置计算的总和或根据需要声明一个初始值。“base”属性设置条形基准绘制的位置(以位置轴单位为单位)。

以下代码呈现一张瀑布图 −

s1=[
   "Sales",
   "Consulting",
   "Net revenue",
   "Purchases",
   "Other expenses",
   "Profit before tax"
]
s2 = [60, 80, 0, -40, -20, 0]
trace = go.Waterfall(
   x = s1,
   y = s2,
   base = 200,
   measure = [
      "relative",
      "relative",
      "total",
      "relative",
      "relative",
      "total"
   ]
)
data = [trace]
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

下面提到的输出是上面给出的代码的结果。

waterfall chart

Funnel Chart

漏斗图以业务流程的不同阶段表示数据。它是商业智能中识别流程潜在问题区域的重要机制。漏斗图用于可视化数据在从一个阶段传递到另一个阶段时如何逐步减少。这些阶段中的每个阶段的数据都表示为 100%(全部)的不同部分。

与饼图一样,漏斗图也不使用任何轴。它也可以被认为类似于 stacked percent bar chart 。任何漏斗都由称为头部(或底部)的上部和称为颈部的下部组成。漏斗图最常见的用途是可视化销售转化数据。

Plotly 的 go.Funnel() 函数生成漏斗追踪。向此函数提供的必要属性为 x 和 y 。每个属性都分配了一个项目 Python 列表或一个数组。

from plotly import graph_objects as go
fig = go.Figure(
   go.Funnel(
      y = [
         "Website visit",
         "Downloads",
         "Potential customers",
         "Requested price",
         "invoice sent"
      ],
      x = [39, 27.4, 20.6, 11, 2]
   )
)
fig.show()

输出如下所示:

funnel chart

Plotly - 3D Scatter and Surface Plot

本章将提供有关三维(3D)散点图和 3D 曲面图的信息,以及如何借助 Plotly 制作它们。

3D Scatter Plot

三维(3D)散点图类似于散点图,但有三个变量 - x, y, and z or f(x, y) 是实数。此图形可表示为三维笛卡尔坐标系中的点。通常使用透视法(等距或透视)将其绘制在二维页面或屏幕上,使得其中一个维度似乎从页面中出现。

3D 散点图用于在三个轴上绘制数据点,以试图显示三个变量之间的关系。数据表中的每一行都由一个标记表示,其位置取决于其在 X, Y, and Z axes 上设置的列中的值。

可以设置第四个变量以对应 markerscolorsize ,从而为该图形添加另一个维度。不同变量之间的关系称为 correlation

Scatter3D trace 是 go.Scatter3D() 函数返回的图形对象。此函数的必需参数是 x, y and z ,它们中的每一个都是 list or array object

例如 -

import plotly.graph_objs as go
import numpy as np
z = np.linspace(0, 10, 50)
x = np.cos(z)
y = np.sin(z)
trace = go.Scatter3d(
   x = x, y = y, z = z,mode = 'markers', marker = dict(
      size = 12,
      color = z, # set color to an array/list of desired values
      colorscale = 'Viridis'
      )
   )
layout = go.Layout(title = '3D Scatter plot')
fig = go.Figure(data = [trace], layout = layout)
iplot(fig)

下面给出代码的输出 −

3d scatter plot

3D Surface Plot

曲面图是三维数据图。在曲面图中,每个点由 3 个点定义:其 latitudelongitudealtitude (X、Y 和 Z)。曲面图不会显示单个数据点,而是显示指定 dependent variable (Y) 与两个自变量(X 和 Z)之间的函数关系。此图形是等值线图的伴随图形。

这里有一个 Python 脚本,用于呈现简单的曲面图,其中 y array 是 x 的转置,z 计算为 cos(x2+y2)

import numpy as np
x = np.outer(np.linspace(-2, 2, 30), np.ones(30))
y = x.copy().T # transpose
z = np.cos(x ** 2 + y ** 2)
trace = go.Surface(x = x, y = y, z =z )
data = [trace]
layout = go.Layout(title = '3D Surface plot')
fig = go.Figure(data = data)
iplot(fig)

下面提到了上面解释的代码的输出 −

3d surface plot

Plotly - Adding Buttons Dropdown

Plotly 通过在绘图区域上使用不同的控件(例如按钮、下拉菜单和滑块等)来提供高度的交互性。这些控件与图形布局的 updatemenu 属性结合使用。可以通过指定要调用的方法来 add button 及其行为。

可以与按钮关联的四种方法如下所示 −

  1. restyle − 修改数据或数据属性

  2. relayout − 修改布局属性

  3. update − 修改数据和布局属性

  4. animate − 启动或暂停动画

图形的 modifying the data and data attributes 时,应该使用 restyle 方法。在下面的示例中,通过 restyle 方法将两个按钮添加到布局中,方法为 Updatemenu()

go.layout.Updatemenu(
type = "buttons",
direction = "left",
buttons = list([
   dict(args = ["type", "box"], label = "Box", method = "restyle"),
   dict(args = ["type", "violin"], label = "Violin", method = "restyle" )]
))

默认情况下, type 属性的值为 buttons 。要显示按钮的下拉列表,将类型更改为 dropdown 。在更新其布局之前,向 Figure 对象添加一个框跟踪。以下是如何根据单击按钮显示 boxplotviolin plot 的完整代码 −

import plotly.graph_objs as go
fig = go.Figure()
fig.add_trace(go.Box(y = [1140,1460,489,594,502,508,370,200]))
fig.layout.update(
   updatemenus = [
      go.layout.Updatemenu(
         type = "buttons", direction = "left", buttons=list(
            [
               dict(args = ["type", "box"], label = "Box", method = "restyle"),
               dict(args = ["type", "violin"], label = "Violin", method = "restyle")
            ]
         ),
         pad = {"r": 2, "t": 2},
         showactive = True,
         x = 0.11,
         xanchor = "left",
         y = 1.1,
         yanchor = "top"
      ),
   ]
)
iplot(fig)

下面给出代码的输出 −

violin button

单击 Violin 按钮以显示相应的 Violin plot

dropdown list button

如上所述, Updatemenu() 方法中 type 键的值被赋值为 dropdown 以显示按钮的下拉列表。绘图如下所示 -

update method

修改图形的数据和布局部分时,应使用 update 方法。以下示例演示如何在同时更新布局属性(例如图表标题)时更新和显示痕迹。两个对应于 sine and cos wave 的散点迹线添加到 Figure object 。可见性 attributeTrue 的痕迹将显示在绘图上,其他痕迹将被隐藏。

import numpy as np
import math #needed for definition of pi

xpoints = np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
y1 = np.sin(xpoints)
y2 = np.cos(xpoints)
fig = go.Figure()
# Add Traces
fig.add_trace(
   go.Scatter(
      x = xpoints, y = y1, name = 'Sine'
   )
)
fig.add_trace(
   go.Scatter(
      x = xpoints, y = y2, name = 'cos'
   )
)
fig.layout.update(
   updatemenus = [
      go.layout.Updatemenu(
         type = "buttons", direction = "right", active = 0, x = 0.1, y = 1.2,
         buttons = list(
            [
               dict(
                  label = "first", method = "update",
                  args = [{"visible": [True, False]},{"title": "Sine"} ]
               ),
               dict(
                  label = "second", method = "update",
                  args = [{"visible": [False, True]},{"title": Cos"}]
               )
            ]
         )
      )
   ]
)
iplot(fig)

最初,将显示 Sine curve 。如果单击第二个按钮,则会出现 cos trace

请注意, chart title 也会相应地更新。

sine curve

为了使用 animate 方法,我们需要添加一个或多个 Frames to the Figure 对象。除了数据和布局之外,还可以将框架作为图形对象中的密钥添加。框架密钥指向一系列图形,其中每一个图形将在触发动画时循环遍历。

你可以添加播放和暂停按钮,通过在布局中添加 updatemenus array ,为图表引入动画。

"updatemenus": [{
   "type": "buttons", "buttons": [{
      "label": "Your Label", "method": "animate", "args": [frames]
   }]
}]

在以下示例中,首先绘制 scatter curve 轨迹。然后添加 frames ,它是一个 50 Frame objects 列表,每个列表代表曲线上的 red marker 。请注意,按钮的 args 属性被设置为 None,因此所有帧都将被动画化。

import numpy as np
t = np.linspace(-1, 1, 100)
x = t + t ** 2
y = t - t ** 2
xm = np.min(x) - 1.5
xM = np.max(x) + 1.5
ym = np.min(y) - 1.5
yM = np.max(y) + 1.5
N = 50
s = np.linspace(-1, 1, N)
#s = np.arange(0, math.pi*2, 0.1)
xx = s + s ** 2
yy = s - s ** 2
fig = go.Figure(
   data = [
      go.Scatter(x = x, y = y, mode = "lines", line = dict(width = 2, color = "blue")),
      go.Scatter(x = x, y = y, mode = "lines", line = dict(width = 2, color = "blue"))
   ],
   layout = go.Layout(
      xaxis=dict(range=[xm, xM], autorange=False, zeroline=False),
      yaxis=dict(range=[ym, yM], autorange=False, zeroline=False),
      title_text="Moving marker on curve",
      updatemenus=[
         dict(type="buttons", buttons=[dict(label="Play", method="animate", args=[None])])
      ]
   ),
   frames = [go.Frame(
      data = [
            go.Scatter(
            x = [xx[k]], y = [yy[k]], mode = "markers", marker = dict(
               color = "red", size = 10
            )
         )
      ]
   )
   for k in range(N)]
)
iplot(fig)

代码的输出如下所示 -

play button

单击 play 按钮后,红色标记将开始沿着曲线移动。

Plotly - Slider Control

Plotly 有一个方便的 Slider ,可用于通过滑动位于渲染绘图底部的控件上的旋钮,更改绘图的 data/style 视图。

Slider control 由不同的属性组成,如下所示 −

  1. steps property 用于定义控件上位移位置。

  2. method property 可能具有 restyle | relayout | animate | update | skip, 值,默认值为 restyle

  3. args property 设置在滑动时要传递给在方法上设置的 Plotly 方法 set 的参数值。

我们现在在散点图上部署一个简单的滑块控件,该控件将使 sine wave 的频率随着旋钮沿着控件滑动而变化。滑块配置为有 50 个步骤。首先添加 50 条具有递增频率的正弦波曲线,除第 10 条迹线外,其余所有迹线都设置为可见。

然后,我们使用 restyle 方法配置每个步骤。对于每个步骤,所有其他步骤对象的可见性都设置为 false 。最后,通过初始化滑块属性来更新图形对象的布局。

# Add traces, one for each slider step
for step in np.arange(0, 5, 0.1):
fig.add_trace(
   go.Scatter(
      visible = False,
      line = dict(color = "blue", width = 2),
      name = "𝜈 = " + str(step),
      x = np.arange(0, 10, 0.01),
      y = np.sin(step * np.arange(0, 10, 0.01))
   )
)
fig.data[10].visible=True

# Create and add slider
steps = []
for i in range(len(fig.data)):
step = dict(
   method = "restyle",
   args = ["visible", [False] * len(fig.data)],
)
step["args"][1][i] = True # Toggle i'th trace to "visible"
steps.append(step)
sliders = [dict(active = 10, steps = steps)]
fig.layout.update(sliders=sliders)
iplot(fig)

首先, 10th sine wave 迹线将可见。尝试沿底部水平控件滑动旋钮。你将看到频率发生变化,如下所示。

sine wave trace

Plotly - FigureWidget Class

Plotly 3.0.0 引入一个新的 Jupyter 小部件类: plotly.graph_objs.FigureWidget 。它具有与我们现有的图形相同的调用签名,并且专门用于 Jupyter NotebookJupyterLab environments

go.FigureWiget() function 返回一个具有默认 x 和 y 轴的空 FigureWidget 对象。

f = go.FigureWidget()
iplot(f)

以下是代码的输出 −

figure widget graph

FigureWidget 最重要的特点是生成的结果 Plotly 图形,并且当我们将数据和其他布局属性添加到它时,它会动态更新。

例如,逐个添加以下图形迹线并查看原始空图形动态更新。这意味着我们不必反复调用 iplot() 函数,因为绘图会自动刷新。FigureWidget 的最终外观如下所示 -

f.add_scatter(y = [2, 1, 4, 3]);
f.add_bar(y = [1, 4, 3, 2]);
f.layout.title = 'Hello FigureWidget'
figure widget

此小部件能够对悬停、单击和选择点以及缩放区域的事件进行监听。

在以下示例中,FigureWidget 被编程为响应绘图区域中的单击事件。小部件本身包含具有标记的简单散点图。鼠标单击位置用不同的颜色和大小标记。

x = np.random.rand(100)
y = np.random.rand(100)
f = go.FigureWidget([go.Scatter(x=x, y=y, mode='markers')])

scatter = f.data[0]
colors = ['#a3a7e4'] * 100

scatter.marker.color = colors
scatter.marker.size = [10] * 100
f.layout.hovermode = 'closest'
def update_point(trace, points, selector):

c = list(scatter.marker.color)
s = list(scatter.marker.size)
for i in points.point_inds:

c[i] = 'red'
s[i] = 20

scatter.marker.color = c
scatter.marker.size = s
scatter.on_click(update_point)
f

在 Jupyter Notebook 中运行以上代码。将显示一个散点图。单击该区域中的某个位置,该位置将用红色标记。

location

Plotly 的 FigureWidget 对象还可以使用 Ipython’s 自己的小部件。此处,我们使用 ipwidgets 模块中定义的交互控制。我们首先构造一个 FigureWidget 并添加一个 empty scatter plot

from ipywidgets import interact
fig = go.FigureWidget()
scatt = fig.add_scatter()
fig

我们现在定义一个 update function ,它输入频率和相位,并设置上面定义的 scatter trace 的 x 和 y 属性。来自 ipywidgets 模块的 @interact decorator 用于创建一组简单的部件来控制绘图的参数。更新函数使用来自 ipywidgets package@interact decorator 进行装饰。装饰器参数用于指定我们要扫过的参数范围。

xs = np.linspace(0, 6, 100)
@interact(a = (1.0, 4.0, 0.01), b = (0, 10.0, 0.01), color = ['red', 'green', 'blue'])
def update(a = 3.6, b = 4.3, color = 'blue'):
with fig.batch_update():
scatt.x = xs
scatt.y = np.sin(a*xs-b)
scatt.line.color = color

空 FigureWidget 现在填充为蓝色,其中 sine curve a 和 b 分别为 3.6 和 4.3。在当前 Notebook 单元格的下方,你将获得一组滑块,用于选择 ab 的值。还有一个下拉列表可用于选择迹线颜色。这些参数在 @interact decorator 中定义。

interact decorator

Pandas 是 Python 中一个非常流行的数据分析库。它也有自己的绘图函数支持。但是,Pandas 绘图没有提供可视化交互性。值得庆幸的是,使用 Pandas dataframe 对象可以构建 plotly 的交互式动态绘图。

我们从简单列表对象构建一个数据框开始。

data = [['Ravi',21,67],['Kiran',24,61],['Anita',18,46],['Smita',20,78],['Sunil',17,90]]
df = pd.DataFrame(data,columns = ['name','age','marks'],dtype = float)

数据框列用作图形对象追踪的 xy 属性的数据值。这里,我们将使用 namemarks 列生成一个条形追踪。

trace = go.Bar(x = df.name, y = df.marks)
fig = go.Figure(data = [trace])
iplot(fig)

将在 Jupyter 笔记本中显示一个简单的条形图,如下所示 −

pandas dataframes

Plotly 的构建基于 d3.js ,它是一个专门的图表库,可以使用另一个名为 Cufflinks 的库直接与 Pandas dataframes 一起使用。

如果尚未安装,可以使用你喜欢的包管理器(如 pip )按照如下方式安装 cufflinks 包:

pip install cufflinks
or
conda install -c conda-forge cufflinks-py

首先,导入 cufflinks 以及其他库,如 Pandasnumpy ,这些库可以将其配置为离线使用。

import cufflinks as cf
cf.go_offline()

现在,你可以直接使用 Pandas dataframe 显示各种类型的图表,而无需使用 graph_objs module 的 trace 和 figure 对象,后者是我们之前一直在使用的。

df.iplot(kind = 'bar', x = 'name', y = 'marks')

下文将显示与之前非常相似的条形图:

pandas dataframe cufflinks

Pandas dataframes from databases

除了使用 Python 列表构造 DataFrame 外,还可以用不同类型的数据库中的数据填充它。例如,可以将 CSV 文件、SQLite 数据库表或 mysql 数据库表中的数据获取到 Pandas DataFrame 中,进而使用 Figure objectCufflinks interface 导出为 plotly 图表。

要从 CSV file 获取数据,我们可以使用 Pandas 库的 read_csv() 函数。

import pandas as pd
df = pd.read_csv('sample-data.csv')

如果数据在 SQLite database table 中可用,则可以使用 SQLAlchemy library 如下方式获取:

import pandas as pd
from sqlalchemy import create_engine
disk_engine = create_engine('sqlite:///mydb.db')
df = pd.read_sql_query('SELECT name,age,marks', disk_engine)

另一方面,从 MySQL database 中获取的数据在 Pandas DataFrame 中如下所示:

import pymysql
import pandas as pd
conn = pymysql.connect(host = "localhost", user = "root", passwd = "xxxx", db = "mydb")
cursor = conn.cursor()
cursor.execute('select name,age,marks')
rows = cursor.fetchall()
df = pd.DataFrame( [[ij for ij in i] for i in rows] )
df.rename(columns = {0: 'Name', 1: 'age', 2: 'marks'}, inplace = True)

Plotly with Matplotlib and Chart Studio

本章介绍了名为 Matplotlib 的数据可视化库和名为 Chart Studio 的在线图表制作工具。

Matplotlib

Matplotlib 是一个流行的 Python 数据可视化库,能够制作可用于生产但静态的图表。您可以借助 plotly.tools 模块中的 mpl_to_plotly() 函数将静态 matplotlib figures 转换为交互式图表。

以下脚本使用 Matplotlib’s PyPlot API 生成 Sine wave Line plot

from matplotlib import pyplot as plt
import numpy as np
import math
#needed for definition of pi
x = np.arange(0, math.pi*2, 0.05)
y = np.sin(x)
plt.plot(x,y)
plt.xlabel("angle")
plt.ylabel("sine")
plt.title('sine wave')
plt.show()

现在,我们按如下方式将其转换为绘图线图形:

fig = plt.gcf()
plotly_fig = tls.mpl_to_plotly(fig)
py.iplot(plotly_fig)

代码的输出如下所示 −

matplotlib

Chart Studio

Chart Studio 是 Plotly 提供的在线图表制作工具。它提供了一个图形用户界面,用于将数据导入网格并对其进行分析,并使用统计工具。可以嵌入或下载图表。它主要用于更快速、更高效地创建图表。

登录 plotly 帐户后,通过访问链接 https://plot.ly/create 启动图表工作室应用程序。网页在图表区域下方提供了一个空白工作表。Chart Studio 允许您通过按 + trace button 来添加图表轨迹。

chart studio

菜单中提供了各种图表结构元素,如注释、样式等,以及保存、导出和共享图表的工具。

让我们在工作表中添加数据并从轨迹类型中添加 choose bar plot trace

choose bar

单击类型文本框,然后选择条形图。

select bar

然后,为 xy 轴提供数据列,并输入图表标题。

data columns