Biopython 简明教程

Biopython - Testing Techniques

Biopython 具有大量的测试脚本,可以在不同的条件下测试软件以确保软件没有错误。要运行测试脚本,请下载 Biopython 的源代码,然后运行以下命令 −

python run_tests.py

这将运行所有测试脚本,并给出以下输出 −

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39)
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)]
Operating system: posix darwin
test_Ace ... ok
test_Affy ... ok
test_AlignIO ... ok
test_AlignIO_ClustalIO ... ok
test_AlignIO_EmbossIO ... ok
test_AlignIO_FastaIO ... ok
test_AlignIO_MauveIO ... ok
test_AlignIO_PhylipIO ... ok
test_AlignIO_convert ... ok
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...........................................

我们也可以运行专门的测试脚本,如下面指定的 −

python test_AlignIO.py

Conclusion

正如我们已经了解的,Biopython 是生物信息学领域的重要软件之一。它用 Python 编写(容易学习和编写),提供广泛的功能来处理生物信息学领域的任何计算和操作。它还提供对几乎所有流行生物信息学软件的轻松灵活的界面,以利用其功能。